作为挂靠车主，您虽非车辆法律上的所有人，但面临车辆无法继续运营需报废的情况时，有权依据《机动车强制报废标准规定》等相关法规，与公司协商处理。若公司拒绝许可，您可尝试通过法律途径解决，如提起诉讼，要求确认报废权利或请求公司协助办理报废手续。请注意，具体操作需结合实际情况及当地法律法规进行。
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从法律角度，确保报废流程顺利进行的关键在于：准备齐全报废所需材料，如身份证、行驶证等；与公司明确报废事宜及费用承担；遵循机动车报废流程，包括填写申请表、申请开具报废通知书、选择回收企业等；保留好相关证明文件，如回收证明、解体照片等，以备后续审批及登记使用。
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若公司同意报废但要求承担额外费用，需判断费用是否合理。一般情况下，报废费用应由车主或公司按约定承担。若无明确约定，可协商分摊。如协商不成，可依据合同内容或相关法律法规，如《合同法》等，通过法律途径解决争议，确保费用承担公平合理。