如果您的自留地被强行取土且自然生态被破坏，侵占者虽同意恢复原状但一年多未履行，您可以依据《民法典》第二百三十五条关于返还原物请求权和第二百三十六条关于排除妨害请求权的规定，向法院提起诉讼，要求侵占者履行恢复原状的义务，并可能要求其承担因不履行承诺而造成的进一步损失赔偿责任。法律为您提供了明确的维权途径。
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从法律角度，您应准备以下材料支持诉求：1.自留地的权属证明，如土地使用权证；2.侵占行为发生前后的照片、视频等，证明生态被破坏的情况；3.与侵占者的沟通记录，包括其同意恢复原状的承诺；4.如有，相关证人证言或书面证明。这些材料有助于法院全面了解案情，支持您的诉求。
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除了诉讼，您还可以尝试以下方式：1.与侵占者再次协商，明确恢复原状的具体时间和方案；2.向当地村委会或政府部门反映情况，请求协助调解或监督执行；3.若侵占行为涉及违法，可向公安机关报案，追究其行政或刑事责任。这些方式可能有助于加快问题的解决。